成為“第三次沖擊”元兇的碇真嗣，變得像廢人一樣……真嗣還能振作起來嗎？2012年《福音戰(zhàn)士新劇場版：Q》之后，這部動畫講述了被封印的故事的后續(xù)。

自幼感情極好的乙骨憂太與祈本里香約好長大后要結(jié)婚，卻不料里香因死亡車禍化為強大怨靈依附在憂太身邊，為此所苦的憂太一心求死，之后在五條悟的帶領(lǐng)下進入咒術(shù)高專結(jié)識了新同學(xué)：禪院真希、狗卷棘與熊貓，他決定在這里找到活下去的自信并解除里香的詛咒。意欲奪取里香強大怨靈力量的夏油杰宣布在12月24日舉行「百鬼夜

在參拜母親墳?zāi)沟幕爻掏局校嫠茫ňw方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻擊，關(guān)鍵時刻2號機勢如破竹挫敗對手，真嗣也由此結(jié)識了2號機的操縱者式波·明日香·蘭格蕾（宮村優(yōu)子 配音）。與沉默寡言的綾波麗（林原惠美 配音）不同，明日香自信張揚，甚至有些自大，在和真嗣相處的日子里，彼此鬧

故事主要回憶太陽系內(nèi)部戰(zhàn)士以及Sailor Moon的覺醒背景。

2012年2月，東京鐵塔上空出現(xiàn)了巨大的數(shù)碼蛋。就在本宮大輔（20歲）和V仔獸修行拉面技藝的時候，遇到了雖然拿著有裂紋的數(shù)碼器，但身邊沒有搭檔數(shù)碼獸的迷之青年——自稱“我沒有數(shù)碼獸，我的搭檔數(shù)碼獸被我殺了，我是世界上最初和數(shù)碼獸建立搭檔關(guān)系的人類。”

2012年2月，東京鐵塔上空出現(xiàn)了巨大的數(shù)碼蛋。就在本宮大輔（20歲）和V仔獸修行拉面技藝的時候，遇到了雖然拿著有裂紋的數(shù)碼器，但身邊沒有搭檔數(shù)碼獸的迷之青年——自稱“我沒有數(shù)碼獸，我的搭檔數(shù)碼獸被我殺了，我是世界上最初和數(shù)碼獸建立搭檔關(guān)系的人類。”