公元2029年，未來世界是高科技與信息化的世界。人類生活水平的提高伴隨著犯罪活動的高科技化，于是，專門鎮壓高科技犯罪的特殊部隊——公安9課成立了。隊長草薙素子，作為一位全身“義體化”的女警，帶領公安9課不斷展開行動。　　是次，公安9課幫助公安6課秘密解決了一位程序員外逃他國的麻煩瑣事，又卷入傳說中

　　宇宙帝國“殘虐”的艦隊突然進攻地球，為了守護愛與夢、和平與人類的笑容，34支超級戰隊集結迎戰，成功將殘虐擊退，但力量也從此消失。　　時間流逝，殘虐再次侵略地球。此時，為尋找最大寶藏的5個宇宙海賊來到了地球，并舉起反對殘虐的旗幟，他們就是海賊戰隊豪快者！

鈴木園子的叔叔次郎吉不甘心失敗，決定再次向怪盜基德發出挑戰。這位壞脾氣的大叔斥巨資制造了巨型的飛船貝爾·雪利二世號，并以鑲嵌有名貴寶石“天空的貴婦人”的戒指作賭注，邀請基德前來挑戰，看他能否在東京到大阪的這6小時時間內完成這項困難的任務。柯南、小蘭等人理所當然也接到邀請，甚至電視臺的人也興師動眾前來

晴朗時節，江戶川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小蘭（山崎和佳奈 配音）以及少年偵探團的伙伴們一同來到京都，他們即將登上自衛隊的宙斯盾戰艦，體驗一把出海作戰的感覺，期間還結識了美麗又有著幾分神秘的女自衛隊員藤井七海（柴咲幸 配音）。誰知快樂的氛圍很快被恐慌所替代，戰艦上突然發現一

公元2029年，未來世界是高科技與信息化的世界。人類生活水平的提高伴隨著犯罪活動的高科技化，于是，專門鎮壓高科技犯罪的特殊部隊——公安9課成立了。隊長草薙素子，作為一位全身“義體化”的女警，帶領公安9課不斷展開行動。　　是次，公安9課幫助公安6課秘密解決了一位程序員外逃他國的麻煩瑣事，又卷入傳說中的