故事發生在北宇治高中的管樂團中。鎧塚霙（種崎敦美 配音）和傘木希美（東山奈央 配音）分別負責雙簧管和長笛的演奏。鎧塚霙從小就性格內向膽小害羞，在國中時一直過著非常孤獨的生活，希美的出現和靠近讓鎧塚霙第一次感受到了友情帶來的溫暖，因此將希美視為自己最珍貴的寶物，沒想到眷戀和依賴帶來的卻是患得患失的不安

高中畢業前最后的暑假，富樫勇太（福山潤 飾）和小鳥游六花（內田真禮 飾）依然過著平靜的生活，只是兩人的關系似乎沒有更進一步的苗頭。在此期間，六花的姐姐十花在意大利找到工作，遂決定舉家遷往海外。而面對重度中二病患者的妹妹——連上大學都成問題的六花，作為姐姐的十花無論如何不放心將她一個人留在日本。得知要

《少女與戰車》最終章六部分中的第二部分。

總有一天不論如何都要一起制作動畫——上山高中動畫同好會的5人向葫蘆屋的甜甜圈如此起誓。她們畢業以后，分別在各自的崗位從事動畫制作，并通過《第三飛行少女隊》而接近了自己的夢想。　　4年后——。在動畫的世界找到了自己的容身之所、逐漸成長起來的5人，開始面對新的苦惱和試煉。