堪稱動畫史上的最強對決到來！傳奇大盜魯邦三世（栗田貫一 配音）和他的戰友次元大介（小林清志 配音）、石川五衛門（浪川大輔 配音）來到東京，以怪盜基德之名挑戰日本警察和柯南（高山南 配音）。在此之后，魯邦高調寄出預告書，揚言要盜取某銀行內的稀世珍寶櫻桃藍寶石，為此國際刑警組織（ICPO）的魯邦三世專門

誰也沒有想到，一起慘無人道的女童虐殺案件竟會讓全日本上下陷入瘋狂。遇害者的爺爺蜷川隆興（山崎努 飾）是在經濟領域執牛耳的大人物，這名悲痛至極的老人在發行量最大的報紙上刊登懸賞啟示，凡能殺死嫌疑人清丸國秀（藤原龍也 飾）的人，將得到10億日元的酬金。這則前所未有的啟示很快發生了作用，擔心自身安全的清丸