在電影FTF里出現的變種alien從一個基因技術研究公司的員工肚子里鉆出來逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他帶Mulder去找那個alien。Scully證明出Gibson可能是外星人（所有人類都可能是）。X檔案現在由Spender和Fowley主管。Gibson最后又不見

丹尼?達可（杰克?蓋倫霍爾 飾）患有精神疾病，某天晚  上他受到莫名的召喚，夢游，也因此逃避了一架飛機墜落在他房間天花板上，這樣匪夷所思的事故。　　自此以后，他的生活就發生了變化，頻頻出現幻覺，他時常看見一個兔人弗蘭克，后者告訴他世界將在28天6小時48分12秒以后毀滅；他得到了一本書，《